治理机制是农业产业化经营组织有效运营的关键，其完善程度影响经营绩效。本文基于中国4省（区）7个地级市221家农民合作社的访谈问卷数据，探究以合作社为纽带的产业化经营组织类型、治理机制与经营绩效之间的关系。结果表明：合约治理不仅对合作社经营绩效产生直接的正向影响，还能通过促进关系治理间接提升经营绩效，合约治理与关系治理存在互补而非替代关系；不同类型合作社的合约治理程度存在显著性差异，但关系治理水平较为相似。相较于公司从属型合作社，原生型合作社的合约治理水平较低，公司主导型合作社的合约治理程度较高。因此，合作社需要审视缔结的产业化经营组织特征，妥善运用合约治理与关系治理两类机制，提高合作社经营绩效。